MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 117050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017267	GC	3	6	8	13	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017267	CAGC	2	8	16	23	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017267	GAT	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017267	GATG	2	8	42	49	25 %	25 %	50 %	0 %	384417080
5	NC_017267	CCCG	2	8	87	94	0 %	0 %	25 %	75 %	384417080
6	NC_017267	TCG	2	6	176	181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417080
7	NC_017267	GCA	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
8	NC_017267	GCC	2	6	418	423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
9	NC_017267	TGT	2	6	473	478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417080
10	NC_017267	GCA	2	6	482	487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
11	NC_017267	CGG	2	6	518	523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417080
12	NC_017267	TTC	2	6	583	588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
13	NC_017267	GAT	2	6	594	599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417080
14	NC_017267	CAG	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
15	NC_017267	TTC	2	6	682	687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
16	NC_017267	TTC	2	6	715	720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
17	NC_017267	GCC	2	6	746	751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
18	NC_017267	ATC	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417080
19	NC_017267	CG	3	6	782	787	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
20	NC_017267	GCCTG	2	10	821	830	0 %	20 %	40 %	40 %	384417080
21	NC_017267	GTCG	2	8	837	844	0 %	25 %	50 %	25 %	384417080
22	NC_017267	CGAT	2	8	845	852	25 %	25 %	25 %	25 %	384417080
23	NC_017267	CCG	2	6	853	858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
24	NC_017267	CGA	2	6	921	926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
25	NC_017267	AAG	2	6	946	951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417080
26	NC_017267	GC	3	6	980	985	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
27	NC_017267	TGG	2	6	995	1000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417080
28	NC_017267	CG	3	6	1001	1006	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
29	NC_017267	GC	4	8	1068	1075	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
30	NC_017267	ACT	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417080
31	NC_017267	GCCG	2	8	1255	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
32	NC_017267	ACCAC	2	10	1265	1274	40 %	0 %	0 %	60 %	384417080
33	NC_017267	TGC	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417080
34	NC_017267	TGCC	2	8	1284	1291	0 %	25 %	25 %	50 %	384417080
35	NC_017267	CCA	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017267	AGT	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017267	CAC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017267	CCTG	2	8	1726	1733	0 %	25 %	25 %	50 %	384417081
39	NC_017267	GGAC	2	8	1762	1769	25 %	0 %	50 %	25 %	384417081
40	NC_017267	TGG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417081
41	NC_017267	ACC	2	6	1847	1852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417081
42	NC_017267	GC	3	6	1882	1887	0 %	0 %	50 %	50 %	384417081
43	NC_017267	CCGT	2	8	1994	2001	0 %	25 %	25 %	50 %	384417081
44	NC_017267	GTG	3	9	2027	2035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417081
45	NC_017267	GCA	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417081
46	NC_017267	CTA	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417081
47	NC_017267	CTG	2	6	2117	2122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417081
48	NC_017267	TTG	2	6	2141	2146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417081
49	NC_017267	GGC	2	6	2207	2212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417081
50	NC_017267	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417081
51	NC_017267	TGCG	2	8	2436	2443	0 %	25 %	50 %	25 %	384417081
52	NC_017267	CGAA	2	8	2469	2476	50 %	0 %	25 %	25 %	384417081
53	NC_017267	AAG	3	9	2544	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417081
54	NC_017267	CGA	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417081
55	NC_017267	AGT	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417081
56	NC_017267	GTT	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017267	TTG	2	6	2817	2822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017267	CTG	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017267	GC	3	6	2943	2948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017267	CGC	2	6	2973	2978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017267	TC	3	6	3011	3016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017267	CGA	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017267	CG	4	8	3107	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017267	AGGT	2	8	3199	3206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017267	AC	3	6	3221	3226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017267	ATC	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017267	AC	3	6	3432	3437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017267	CG	3	6	3514	3519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017267	AAT	2	6	3538	3543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017267	TGG	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017267	GTT	3	9	3596	3604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017267	CCTG	2	8	3719	3726	0 %	25 %	25 %	50 %	384417082
73	NC_017267	TCG	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
74	NC_017267	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417083
75	NC_017267	AAC	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417083
76	NC_017267	TGGAA	2	10	4041	4050	40 %	20 %	40 %	0 %	384417083
77	NC_017267	GGC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417083
78	NC_017267	TGC	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
79	NC_017267	CGT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
80	NC_017267	GCG	2	6	4215	4220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417083
81	NC_017267	GTG	2	6	4221	4226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417083
82	NC_017267	CCG	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417083
83	NC_017267	CGT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
84	NC_017267	GC	4	8	4303	4310	0 %	0 %	50 %	50 %	384417083
85	NC_017267	GCT	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
86	NC_017267	GC	3	6	4341	4346	0 %	0 %	50 %	50 %	384417083
87	NC_017267	CG	3	6	4601	4606	0 %	0 %	50 %	50 %	384417083
88	NC_017267	CAAGC	2	10	4661	4670	40 %	0 %	20 %	40 %	384417083
89	NC_017267	GCCT	2	8	4682	4689	0 %	25 %	25 %	50 %	384417083
90	NC_017267	GAC	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417083
91	NC_017267	CAC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417083
92	NC_017267	GC	3	6	4784	4789	0 %	0 %	50 %	50 %	384417083
93	NC_017267	CCCG	2	8	4846	4853	0 %	0 %	25 %	75 %	384417083
94	NC_017267	TGT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017267	CGA	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
96	NC_017267	TGC	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
97	NC_017267	GGT	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
98	NC_017267	CGA	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
99	NC_017267	CGA	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
100	NC_017267	GTG	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
101	NC_017267	GAA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417084
102	NC_017267	TGC	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
103	NC_017267	CGG	2	6	5377	5382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
104	NC_017267	CGA	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
105	NC_017267	CGG	2	6	5413	5418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
106	NC_017267	GGCGTG	2	12	5426	5437	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384417084
107	NC_017267	GGT	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
108	NC_017267	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
109	NC_017267	AGC	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
110	NC_017267	CAC	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417084
111	NC_017267	CCGT	2	8	5588	5595	0 %	25 %	25 %	50 %	384417084
112	NC_017267	GGCGC	2	10	5635	5644	0 %	0 %	60 %	40 %	384417084
113	NC_017267	CGA	2	6	5692	5697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
114	NC_017267	CGA	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
115	NC_017267	GGC	2	6	5735	5740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
116	NC_017267	CGC	2	6	5778	5783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
117	NC_017267	TGG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
118	NC_017267	CAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417084
119	NC_017267	GGC	2	6	5909	5914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
120	NC_017267	CCGCG	2	10	5932	5941	0 %	0 %	40 %	60 %	384417084
121	NC_017267	CGA	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
122	NC_017267	CGG	2	6	6117	6122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
123	NC_017267	GC	3	6	6140	6145	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
124	NC_017267	CGAA	2	8	6171	6178	50 %	0 %	25 %	25 %	384417084
125	NC_017267	TCG	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
126	NC_017267	CG	3	6	6211	6216	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
127	NC_017267	GC	3	6	6218	6223	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
128	NC_017267	CG	3	6	6229	6234	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
129	NC_017267	GC	3	6	6239	6244	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
130	NC_017267	CGC	2	6	6254	6259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
131	NC_017267	GC	3	6	6264	6269	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
132	NC_017267	TGC	2	6	6405	6410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
133	NC_017267	GC	3	6	6443	6448	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
134	NC_017267	CGA	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
135	NC_017267	ACC	2	6	6546	6551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417084
136	NC_017267	CAT	2	6	6553	6558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417084
137	NC_017267	TGA	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417084
138	NC_017267	CCGACG	2	12	6567	6578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384417084
139	NC_017267	CTT	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417084
140	NC_017267	GCC	2	6	6670	6675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
141	NC_017267	GCG	2	6	6767	6772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
142	NC_017267	CGA	2	6	6787	6792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
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144	NC_017267	CTG	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
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146	NC_017267	GCC	2	6	6913	6918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
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148	NC_017267	CG	3	6	7009	7014	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
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155	NC_017267	CAA	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417084
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160	NC_017267	GCC	2	6	7391	7396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
161	NC_017267	CGC	2	6	7439	7444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
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163	NC_017267	CGGTG	2	10	7536	7545	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017267	GAC	2	6	7553	7558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017267	GCC	2	6	7610	7615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
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189	NC_017267	G	6	6	8572	8577	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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214	NC_017267	CTG	2	6	9466	9471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
215	NC_017267	CGG	2	6	9643	9648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
216	NC_017267	GCAA	2	8	9682	9689	50 %	0 %	25 %	25 %	384417087
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245	NC_017267	TGC	2	6	10934	10939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_017267	ATC	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_017267	AAC	2	6	11020	11025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_017267	CACTG	2	10	11117	11126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
249	NC_017267	ATG	2	6	11127	11132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417088
250	NC_017267	CAG	2	6	11164	11169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417088
251	NC_017267	CAC	2	6	11180	11185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417088
252	NC_017267	TGG	2	6	11197	11202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417088
253	NC_017267	CCT	2	6	11211	11216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384417088
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258	NC_017267	GGT	2	6	11324	11329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417088
259	NC_017267	CGC	2	6	11365	11370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417088
260	NC_017267	CCG	2	6	11376	11381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417088
261	NC_017267	CCG	2	6	11445	11450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417088
262	NC_017267	CCG	2	6	11457	11462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417088
263	NC_017267	GTCG	2	8	11540	11547	0 %	25 %	50 %	25 %	384417088
264	NC_017267	TGC	2	6	11579	11584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417088
265	NC_017267	GCA	2	6	11592	11597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417088
266	NC_017267	TCA	2	6	11739	11744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_017267	CA	4	8	11746	11753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
268	NC_017267	TGC	2	6	11770	11775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417089
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271	NC_017267	TCA	2	6	11950	11955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417089
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276	NC_017267	GCA	2	6	12133	12138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417089
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382	NC_017267	TGA	3	9	16516	16524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_017267	GGC	2	6	16912	16917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
389	NC_017267	GACCT	2	10	16963	16972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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